Moleküler
biyoloji araştırma laboratuvarı olarak tıp, eczacılık, tarım ve veterinerlik gibi
kamu ve özel sektöre birçok alanda çalışma alanlarımız dahilinde hizmet
vermekteyiz.
Moleküler Biyoloji Laboratuvarımızda organizmaların, moleküler düzeyde yapı ve işlevlerinin incelenmesi, DNA ve RNA izolasyonu/çoğaltması, saflık tayinleri (spektrofotometrik ve elektroforez yöntemleri), Western Blot, RT-PCR, PCR gibi çeşitli genetik uygulamalar yapılmaktadır ve bu veriler sayesinde hastalıklardaki temel moleküler mekanizmaları aydınlatma, tanı/ tedaviye yönelik bilgi edinme ve araştırma imkânı sunmaktadır.
Hücre kültürü laboratuvarımızda hücrelerin
çözülmesi, çoğaltılması, pasajlanması, uygulama yapılması ve dondurulması gibi
standart hücre kültürü protokolleri uygulanmaktadır. Bu amaçla insan ve hayvan
kaynaklı primer hücreler veya kanser hücre serileri kullanılmaktadır.
Bio-Rad Trans-Blot
Turbo Transfer Sistemi
Western blotlama herhangi bir biyolojik örnekte spesifik bir proteinin varlığını, büyüklüğünü ve konsantrasyonunu tespit etmek için kullanılan bir yöntemdir. Yöntem kısaca şu şekildedir: Analize tabi biyolojik materyalden proteinler ekstrakt edilerek protein jel elektroforezi yöntemiyle jel üzerinde ayrıştırılırlar. Elde edilen jel bir membran üzerine alınır ve elektrik alana maruz bırakılarak jeldeki proteinlerin membran üzerine aktarılması sağlanır. Daha sonra aranılan proteine özgü antibodilerve o antibodiye özgü boyama yöntemleri kullanılarak aranılan protein membran üzerinde tespit edilir. Proteinlerin jelden membranlara aktarılmasında kullanılan cihazlara blotlama cihazları denir.
Merkezimizde bulunan Trans-Blot Turbo jel içerisindeki proteinleri membrana dakikalar içerisinde transfer eden hızlı ve etkili bir Western Blotlama aparatıdır.
Mini ve midi jellerden 3 dakikada PVDF veya Nitroselüloz membranlarına protein aktarımı gerçekleşmektedir.
Bio-Rad Trans-Blot Turbo
Bio-Rad ChemiDoc MP Görüntüleme Sistemi
Jel ya da Western Blotlama için geniş özellikli bir görüntüleme sistemidir. Multipleks floresan western blotlama, kemiluminesans görüntüleme ve genel jel dokümantasyonu için özel dizayn edilmiştir. Yüksek çözünürlüklü CCD-kamera, yüksek hassasiyette deteksiyon teknolojisi ve modüler lens opsiyonları sunar.
Çoklu görüntüleme özelliği – ChemiDoc MP görüntüleme sistemi, multipleks floresan western blotlama dahil çok farklı örnek çeşitlerinden görüntü almanızı sağlar. Protein ve DNA elektroforezinize eşlik edecek ideal sistemdir. Kantitatif, tekrarlanabilir floresan sonuç ve kemulimensan ve kolorimetrik deteksiyon sunar.
Stain-free teknolojisi – UV altında floresan boyama ile protein görüntülemesini 5 dakikaya indirger ve 2 saatlik Coomassie mavisi ile boyama ve ardından de-stain prosedüründen kurtarır.
Bio-Rad ChemiDoc MP
Real-Time PCR Cihazı
Real-time PCR DNA’nın çoğaltımını
ve ürünlerini tek bir tüpte belirlemeyi mümkün kılan çok yakın bir zamanda
uygulamaya konulan popüler bir metotdur. Gen anlatımının analizini değiştiren
bu metot ile geleneksel PCR yöntemi ve gen analizi birleştirilmiştir. PCR
çoğaltımını görünür hale getiren ve monitorize edebilen floresan işaretli prob
ve boyaların kullanıldığı, floresanın oluşan DNA ile doğru orantılı olarak
arttığı bir çoğaltma yöntemidir.
Biyolojik örneklerden elde edilen
DNA’nın kopya sayısını sayısal değerlere dönüştürme ve mRNA’nın düzeyini
sayısal olarak belirleyebilme en çok kullanılan alanlarını oluşturmaktadır. Bu
amaçlarla kullanımının yanı sıra tek nokta mutasyonlarını belirleme, patojen
belirleme, DNA hasarı belirleme, metilasyon tespiti ve SNP analizi gibi
çalışmalarda da kullanım alanları mevcuttur.
Laboratuarımızda
mevcut olan Real-Time PCR cihazı Roche LightCycler® 480 II dir.
LightCycler® 480 sistemi; gen saptama, gen ekspresyonu analizi, genetik
varyasyon analizi ve dizi verisi validasyonu için çeşitli yöntemler sağlayan
orta ile yüksek iş hacimli bir PCR platformudur. Kuyucuklar arası homojenlik ve
saptama duyarlılığı sağlayan termal blok ve optik teknolojisini kullanır. Veri
analiz yöntemleri yoluyla, MIQE kılavuzları doğrultusunda sonuçlar elde
edilebilir ve pasif referans boyalara veya normalizasyon plakalarına gerek
duymadan gerçek manada işlenmemiş verileri analiz edilebilir. LightCycler® 480 Sistemi;
tek renkli veya çok renkli uygulamaları destekleyen çok yönlü, plaka bazlı,
gerçek zamanlı bir PCR cihazı içerir.
Kullanım alanları:
- Genetiği değiştirilmiş organizmaların (GDO) tespitinde,
- Doğum öncesi tanı çalışmalarında,
- Genotipleme ve gen ekspresyonu çalışmalarında,
- Onkolojik çalışmalarda,
- DNA hasarı incelemelerinde,
- Patojen tespitinde,
- Et tür tayininde,
- Adli tıp çalışmalarında,
- Mutasyon ve mutagenez çalışmalarında kullanılır.
Real-Time PCR cihazı Roche LightCycler® 480 II
Moleküler Biyoloji ve Hücre Kültürü Laboratuvarı